Eaux usées en France : pourquoi l’épuration est devenue une urgence nationale ?

Plus d’une station d’épuration sur cinq en France ne respecte pas les normes en vigueur. Entre pression européenne, raréfaction de la ressource et nouvelles obligations réglementaires, le traitement des eaux usées s’impose comme un chantier prioritaire pour les années à venir. Le point sur une situation qui appelle des réponses concrètes.

Un parc d’épuration sous tension, une Europe qui hausse le ton

Sur les 22 901 stations de traitement des eaux usées actives recensées en France en 2024, 5 157 présentent un statut de non-conformité, soit environ 22,5 % du total, selon une enquête cartographique publiée en août 2026 et fondée sur la base nationale des systèmes d’assainissement collectif du ministère de la Transition écologique. La non-conformité ne signifie pas nécessairement que des eaux usées sont rejetées sans traitement : elle peut résulter de dépassements de seuils, d’un fonctionnement insuffisant, ou encore de données de surveillance incomplètes. Le ministère lui-même souligne que les chiffres relatifs aux petites installations (moins de 2 000 équivalents-habitants) présentent un taux de fiabilité plus faible.

Reste que les conséquences environnementales d’un traitement réellement insuffisant sont bien réelles : apports excessifs d’azote et de phosphore dans les cours d’eau, réduction de l’oxygène dissous, risques d’eutrophisation. Face à ce constat, l’Europe a réagi. En juillet 2026, la Commission européenne a adressé à la France une lettre de mise en demeure : 518 agglomérations d’assainissement ne respecteraient pas toutes leurs obligations. La France avait déjà été condamnée par la Cour de justice de l’UE en octobre 2024 pour des manquements constatés dans 78 agglomérations. Les contentieux en cours font peser un risque financier croissant sur les collectivités, notamment les plus petites, dont les moyens pour moderniser ou reconstruire leurs installations restent limités.

Pour accompagner ces collectivités, Atlantique Industrie propose des équipements couvrant l’ensemble de la chaîne d’épuration, du prétraitement au traitement des boues, avec des solutions adaptées à différentes échelles d’installation.

La directive DERU 2 : des exigences qui montent d’un cran

Publiée en décembre 2024 et entrée en vigueur le 1er janvier 2025, la directive 2024/3019 (dite DERU 2) doit être transposée en droit français avant le 31 juillet 2027. Elle rehausse sensiblement les obligations pesant sur les gestionnaires de stations.

Les stations de plus de 150 000 équivalents-habitants devront mettre en œuvre un traitement tertiaire de l’azote et du phosphore d’ici 2033 à 2039. Mais la nouveauté la plus structurante concerne le traitement quaternaire, désormais obligatoire pour éliminer les micropolluants : médicaments, perturbateurs endocriniens, résidus industriels. La directive retient un rendement d’élimination minimal de 80 % sur un panel de molécules de référence, en s’inspirant de l’approche suisse. Toutes les stations de plus de 10 000 EH devront par ailleurs atteindre la neutralité énergétique d’ici 2045, ce qui implique de valoriser la digestion anaérobie, la récupération de chaleur et d’autres sources d’énergie renouvelable. Les experts pointent une tension réelle : aller plus loin dans le traitement de l’azote consomme davantage d’énergie, ce qui rend l’objectif de neutralité plus difficile à atteindre. Sur le plan financier, la directive prévoit que les fabricants de médicaments à usage humain et de produits cosmétiques financent au moins 80 % des coûts du traitement quaternaire, dans le cadre d’un mécanisme de responsabilité élargie des producteurs, encore débattu.

La réutilisation des eaux traitées, un potentiel encore largement inexploité

La France réutilise aujourd’hui seulement 0,6 % de ses eaux usées traitées, contre 14 % en Espagne et 8 % en Italie. Le Plan Eau, lancé en mars 2023, fixe un objectif de 10 % de réutilisation à l’horizon 2030, ce qui représente un effort considérable. Selon les données disponibles, 1,6 milliard de mètres cubes par an pourraient redevenir exploitables grâce à la REUT, pour des usages aussi variés que l’irrigation agricole, l’arrosage des espaces verts, le lavage des voiries ou la lutte contre les incendies.

Le cadre réglementaire s’est étoffé rapidement : un décret d’août 2023, plusieurs arrêtés fin 2023, un décret de janvier 2024 sur les entreprises alimentaires, et une instruction interministérielle de juillet 2024 instaurant un guichet unique pour simplifier les démarches d’autorisation. En 2024, 21 projets de REUT ont été mis en service et 169 sites disposent d’une autorisation. L’effort reste à amplifier, dans un contexte où la sécheresse pousse régulièrement des dizaines de départements à des restrictions d’usage de l’eau, comme en juillet 2024 ou pendant l’été 2019 où 87 départements avaient été concernés.

Entre conformité réglementaire, nouvelles exigences européennes et enjeux liés à la ressource, le secteur de l’épuration entre dans une décennie de transformation profonde. Les outils techniques existent ; leur déploiement à grande échelle sera l’enjeu des prochaines années.

A ne pas manquer